A nova versão do COVID Omicron Variant, BA.2, é um pequeno bastardo sorrateiro

Existe uma nova forma de Alternativa Omicron ao vírus corona—Que os especialistas dizem que é difícil distinguir de variável delta Usando reação em cadeia da polimerase padrão ou testes de PCR.

O surgimento desta variante camuflada ‘BA.2’ – ‘sub-estirpe’ sendo o termo científico – é o mais recente desenvolvimento na crise ainda em desenvolvimento que foi desencadeada pela linha de base BA.1 da Omicron após autoridades de saúde sul-africanas Confirme a nova linhagem, com dezenas de mutações importantes, há duas semanas.

A subespécie BA.2 difícil de distinguir também é um poderoso lembrete de não imune para ser vacinado e sem reforço para receber um impulso. Há muito que não sabemos sobre a Omicron e suas subsidiárias, mas os primeiros sinais apontam para vacinas pioneiras Ainda funciona bem contra eles. E, claro, todos os socos funcionam melhor com uma poção de reforço.

Os cientistas descobriram o BA.2 furtivo pela primeira vez alguns dias atrás, após o sequenciamento genético de um lote de amostras de teste feitas por funcionários África do Sul, Austrália e Canadá compilados. Até o momento, a subvariante foi identificada em 30 países e seis continentes.

“Você ainda pode detectá-lo por PCR, mas não pode diferenciá-lo da cepa delta dominante”, disse Rob Knight, chefe do Laboratório de Computação Genética da Universidade da Califórnia, em San Diego, ao The Daily Beast. Em outras palavras, um teste de PCR pode dizer que você tem COVID, mas pode Não Digo que você capturou especificamente o BA.2.

Para ser justo, a não discriminação pode ser um problema. Se Omicron e seus sub-linhas se revelarem mais perigosos do que Delta e seus sub-linhas, será realmente importante saber quantos casos de Omicron existem como um subconjunto de todas as infecções COVID. Ou seja, até que ponto o omicron “permeou” uma população, para usar o termo epidemiológico.

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“Essa suposta ‘variável oculta’ provavelmente significa que há mais penetração dessas variáveis ​​preocupantes circulantes do que imaginamos”, disse o especialista em saúde global da Universidade de Georgetown, Lawrence Justin, ao The Daily Beast. Isso não significa que não possamos avaliar o potencial aumento alimentado pela Omicron em casos que parecem já estar em andamento na maior parte do mundo. Ele Ela Fazer Isso significa que estamos tentando recuperar o atraso enquanto ajustamos nossos testes de PCR e fazemos um sequenciamento genético mais detalhado das amostras.

O Dr. Lawrence Justin chama isso de “alternativa invisível”.

Chip Somodevilla / Getty Images

Para entender como BA.2 pode se esconder atrás do Delta e, portanto, potencialmente obscurecer a verdadeira extensão da propagação do Omicron, você precisa entender como funcionam os testes de PCR. O PCR inclui uma amostra de vírus em potencial e uma “matéria-prima” projetada pelos criadores do teste para estimular a multiplicação do vírus. Exponha a amostra no primer e aguarde um pouco. Se o vírus se multiplicar, você obterá um resultado de teste positivo.

Aqui está o ponto. Os testes de reação em cadeia da polimerase (PCR) não são bons para diferenciar uma cepa de vírus de outra. Você pode projetar o primer para corresponder a algumas das características exclusivas da raça que mais o preocupam, mas como muitas cepas compartilham características genéticas, o teste pode dar positivo para o vírus, mas é inconclusivo para a cepa.

Os especialistas inicialmente esperavam que pudéssemos usar o mesmo teste de PCR que usamos para detectar a antiga cepa alfa do SARS-CoV-2 para também encontrar o Omicron. Isso ocorre porque alfa e omicron compartilham um marcador genético. “Os aminoácidos 69 e 70 são deletados no gene spike”, de acordo com Nima Moshiri, geneticista da Universidade da Califórnia, em San Diego.

Aqui está o problema. “A nova sub-linhagem de Omicron, BA.2, não contém essa exclusão”, disse Moshiri ao The Daily Beast. Adivinhe quais são as proporções além disso Pretende omitir esta eliminação? Isso mesmo: delta. Portanto, os técnicos de laboratório que usam testes alfa antigos para procurar Omicron podem perder casos de BA.2. Enquanto isso, os tecnólogos que procuram Delta podem calcular uma série de estados BA.2 também.

A ambigüidade do teste pode nos atrasar enquanto tentamos lidar com o quão ruim o Omicron é, onde e com que rapidez ele pode se espalhar. Mas na verdade não nos impedirá de compreender ou tratar as novas linhagens e seus sub-linhas.

Afinal, ainda contamos com o sequenciamento genético detalhado, em vez de um teste rápido de PCR, para verificar e rastrear o novo coronavírus. “Por meio do sequenciamento, seremos capazes de determinar a linhagem de qualquer maneira, independentemente de BA.1 ou BA.2”, explicou Moshiri.

Mas o sequenciamento é mais caro do que o teste e leva mais tempo. “É um problema significativo”, disse Knight.

No entanto, a incapacidade de BA.2 de se esconder da sequência é o motivo pelo qual Keith Jerome, um virologista da Universidade de Washington, disse que não está tão preocupado. O laboratório de Jerome descobriu os três primeiros casos de omicron no estado de Washington na semana passada. Jerome disse que Washington sequencia 14% dos testes, então BA.2 não pode ficar escondido por muito tempo. “Esta subvariante do Omicron pode se esconder por um ou dois dias, mas se se tornar comum, nós a encontraremos por meio de sequenciamento aleatório.”

Tudo isso significa, sim, BA.2 é um problema. A escala do problema depende, em grande medida, da seriedade da Omicron após um estudo mais aprofundado. “Pode ser possível internalizar essas variáveis ​​como uma nova forma natural pós-pandêmica, assim como a influenza, caso em que o teste – embora seja importante para detectar pontos quentes e avaliar ou antecipar cargas potenciais – pode não ser tão vital”, disse o epidemiologista do CDC, Global Health University of South Florida Infectious Disease Research for The Daily Beast.

Em qualquer caso, BA.2 é um problema com soluções óbvias. Novos primers de PCR. Mais sequência. E como de costume, máscaras, vacinas e reforço. “Sei que todos estão ‘animados’ com a Omicron”, disse Stephanie James, chefe do laboratório de testes COVID da Regis University, no Colorado, ao The Daily Beast. Mas as variáveis ​​são esperadas pela comunidade científica. O conselho é o mesmoVacine-se e use uma máscara. “

Menno Lange

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