Avaliação detalhada da origem e disseminação do tipo delta SARS-CoV-2 no Brasil

O número de casos da doença do vírus corona (COVID-19) no Brasil continua aumentando devido à variação do delta. Isto é particularmente preocupante após o aparecimento da variante P1 (gama) (VOC) preocupante, que tem se espalhado ativamente por todo o país desde 20 de janeiro.1.

O COV da Síndrome Respiratória Delta Aguda Corona Vírus 2 (SARS-CoV-2), que se originou na Índia, agora se espalhou pelo mundo, contribuindo para um aumento na hospitalização e mortalidade. No entanto, sua origem e distribuição no Brasil ainda não estão claras.

Estude: SARS-CoV-2 delta variante de ansiedade no Brasil – muitas introduções, primeiros sinais de mudança social e evolução local. Crédito de imagem: malazzama / Shutterstock.com

Apesar de relatos frequentes de casos isolados de vários estados brasileiros como São Paulo (SP), Rio de Janeiro (RJ), Minas Gerais (MG) e Rio Grande do Sul (RS), faltam informações sobre a função de variação delta no Brasil. ), Tokantins (TO), Barão (PR), Gois (GO) e Maranhão (MA).

Pesquisadores brasileiros de diferentes instituições de ensino colaboraram para classificar a prevalência de Delta VOC no Brasil e para avaliar sua origem na filogenia delta global. Os pesquisadores deste estudo publicaram em um servidor de impressão medRxiv*, A Delta brasileira também categorizou o maior perfil mútuo de clados em VOCs, com foco em amostras obtidas no estado de São Paulo, especialmente na maior metrópole da América do Sul, São Paulo. E o Centro de Transporte Internacional.

Origem do Delta VOC no Brasil e sua avaliação filogenética

Os pesquisadores obtiveram todas as amostras positivas para SARS-CoV-2 da plataforma de laboratório para diagnóstico de coronavírus, que foi estabelecida pelo Butão. Os pesquisadores selecionaram e classificaram aproximadamente 7-10% dos valores da taxonomia genética (Ct) de aproximadamente uma semana epidêmica (EPV) a 35 para a classificação genética. Em seguida, os pesquisadores isolaram amostras e material de ácido ribonucléico mensageiro (MRNA). Fez diagnósticos moleculares para avaliar VOCs.

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Os primeiros casos de infecção Delta VOC no Brasil foram descobertos em um navio cargueiro que partia da Malásia em 27 de março de 2021, e tinha conexão com a África do Sul, que chegou ao Brasil em 14 de maio de 2021. Seis deles são favoráveis ​​ao delta. Também foi descoberto que causa disseminação social.

Os pesquisadores identificaram pelo menos quatro cadeias de trocas sociais independentes em relação ao estado, cada uma em RJ, GO, MA, PR. Eles observaram simultaneamente que algumas amostras do mesmo estado pertenciam a classes diferentes. Por exemplo, modelos SP nas classes III e V, enquanto RJ foi encontrado nas classes I e V nas classes III e VI e PR, sugerem que esses achados sugerem vários padrões introdutórios na população brasileira.

São Paulo, a maior cidade do continente americano, teve amostras positivas principalmente em seus bairros do norte. A primeira amostra coletada em São Paulo desde o final de junho de 2021 veio da região sudeste da Grande São Paulo, de onde se acredita ter vindo do RJD, por meio da Secretaria Regional de Saúde da DuPont. Em 29 de abril, 84 amostras foram identificadas em seis setores de saúde regionais distintos com o estado de São Paulo, indicando que o Delta VOC continua a aumentar, sobrecarregando o sistema de saúde do país e evitando a neutralidade baseada em vacinas.

Implicações do estudo

Ao examinar o impacto da propagação do Delta VOC no Brasil, os pesquisadores concluíram que haveria pelo menos 10 introduções diferentes de Delta VOC em oito estados brasileiros no primeiro semestre de 2021. Quatro cadeias de troca aparentemente não relacionadas foram identificadas nos estados de São Paulo, Paraná, Coyce e Maranho, o que confirmou a presença e transferência da Delta VOC no Brasil.

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Finalmente, uma mutação local estável (ORF1ab: T4087I), uma conversão hidrofóbica de um aminoácido hidrofílico, também foi encontrada em um relatório publicado anteriormente. Este achado sugere o surgimento de variantes locais que podem causar mais danos, evitando a proteção baseada na vacina.

Embora as análises iniciais indiquem que as vacinas SARS-CoV-2 usadas em todo o país podem fornecer proteção contra VOC delta, a introdução de qualquer VOC em um país requer atenção significativa. Essas avaliações da origem, evolução e distribuição baseada na comunidade de VOCs delta no Brasil são um bom exemplo de estudos futuros de outros VOCs em várias partes do mundo. Juntos, esses resultados podem ajudar a reduzir a carga sobre o sistema de saúde e melhorar as estratégias de vacinação.

*Últimas notícias

medRxiv Publica relatórios científicos preliminares revisados ​​por pares e, portanto, não deve ser considerado conclusivo, orientando a prática médica / comportamento relacionado à saúde ou informações estabelecidas.

Tadday Köhler

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